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潔凈室(區)內各種管道，在設計和安裝時應考慮使用中避免出現不易清洗的部位。管道內壁應光滑，管道設計要減少支管、管件、閥門和盲管。為便于清洗、滅菌，需要清洗、滅菌的零部件要易于拆裝，不便拆裝的要設清洗口。無菌室設備、管道要適應滅菌需要，輸送無菌介質的管道應采取滅菌措施或采用衛生薄壁可拆卸式管道。管道與閥門連接宜采用法蘭、螺紋或其他密封性能優良的連接件，采用法蘭連接時宜使用不易積液的對接法蘭、活套法蘭。凡接觸物料的法蘭和螺紋的密封應采用聚四氟乙烯，液體的輸送管路的安裝盡量減少連接處，密封墊宜采用硅橡膠等材料。
無塵車間凈化工程最主要的作用在于控制產品所接觸的空氣的無塵度及溫濕度，使產品能在一個良好的環境空間中生產、制造，此空間我們稱之為無塵車間。按照國際慣例，無塵凈化級別主要是根據每立方米空氣中粒子直徑大小劃分標準的粒子數量來規定。
根據物料性質的不同，管道應有一定坡度。其坡度方向一般為順介質流動方向(蒸汽管相反)，坡度大小為:蒸汽0.005，水0.003，冷凍鹽水0.003，生產廢水0.001，蒸汽冷凝水0.003，壓縮空氣0.004，清凈下水0.005，一般氣體與易流動液體0.005，含固體結晶或黏度較大的物料0.01。管道通過人行道時，離地面高度不少于2m；通過公路時不小于4.5m；通過工廠主要交通干道時一般應為5m。長距離輸送蒸汽的管道，在一定距離處應安裝冷凝水排除裝置，長距離輸送液化氣體的管道，在一定距離處應安裝垂直向上的膨脹器。
初，確實認為這種單向平行的氣流應該充滿整個潔凈室，但這在技術上和經濟上都是不利的。隨著認識的發展，人們又指出這種單向流只是“在有限的領域內空氣沿平行流線以等速流動的意思”，并認為能力抑制渦流的發生。通過全空間的清潔空氣的單向流特性占支配的那樣的房間，也稱為單向流潔凈室。這就是說，不要求在整個房間都具有單向平行的流線，均勻的速度，沒有渦流，而是只要求單向平行流特性在這個房間中占支配，例如在整個工作區這一層空間了單向流，這個房間就是單向流潔凈室。前面介紹過的國內外有關標準、措施中關于單向流潔凈室達到的高潔凈度，就是指在工作區內達到的潔凈度。因此，密集布置的流線型散流器頂送和全孔板頂送，也被作為實現垂直單向流的手段使用。