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醫療無塵車間的潔凈室是指將一定空間范圍內之空氣中的微粒子、細菌等之污染物排除，并將室內之溫度、潔凈度、室內壓力、氣流速度與氣流分布、噪音振動及照明、靜電控制在某一需求范圍內，而所給予設計建成的醫療無塵車間潔凈房間。醫療無塵車間內潔凈室的原理。潔凈室是利用HEPA、空氣凈化設備，其塵埃的收集率達99.97~99.%之多，因此經過此過濾器過濾的空氣可說十分干凈。然而潔凈室內除了人以外，尚有機器等之發塵源，這些發生的塵埃一旦擴散，即無法保持潔凈空間，因此利用氣流將發生的塵埃迅速排出室外。
無塵車間凈化工程最主要的作用在于控制產品所接觸的空氣的無塵度及溫濕度，使產品能在一個良好的環境空間中生產、制造，此空間我們稱之為無塵車間。按照國際慣例，無塵凈化級別主要是根據每立方米空氣中粒子直徑大小劃分標準的粒子數量來規定。
增加了公制單位，潔凈室等級以‵M′字頭表示，如M1、M1.5、M2.5、M3….以此類推，配合公制單位之標準化，M字母后之阿拉伯數目字是以每立方公尺中=0.5μm之微塵粒子數目字以10的冪次方表示，取指數為之，若微塵粒子數介于前后二者冪次方之間，則以1.5、2.5、3.5….表示。美國聯邦標準FS?209D都以英制每立方英尺為單位，日本則是采用公制，即以每立方公尺為單位，以0.1μm微粒子為計數標準。日本標準之表示法以Class?1，Class?2，Class?3……Class8表示，度的等級為Class?1，差則為Class?8，以每立方公尺中微塵粒子總數中化為10的冪次方，取其指數而得。
非單向流凈化車間非單向流的凈化原理是靠送風氣流不斷稀釋室內空氣，把室內污染逐漸排出，達到平衡，即稀釋原理。具體來講，就是利用干凈氣流的混合稀釋作用，把室內含塵濃度很高的空氣稀釋，使室內污染源所產生的污染物質均勻擴散并及時排出室外，降低室內空氣的含塵濃度，使室內的潔凈度達到要求。非單向流凈化車間的氣流流型又可分為頂送下回、頂送下側回、頂送頂回等。一般形式為過濾器送風口頂部送風；回風的形式有下部回風、側下部回風和頂部回風等。依不同送風換氣次數，實現不同的凈化級別，其初投資和運行費用也不同。非單向流凈化車間的特性包括:換氣次數，與舒適性空調相同；氣流組織，即能均勻地送風和回風，充分發揮潔凈氣流的稀釋作用，要求單個風口有的擴散作用，整個凈化車間室內風口布置均勻，數量盡可能多，要盡量減少渦流和氣流回旋；自凈時間，室內從某污染狀態降低到某潔凈狀態所需要的時間，自凈時間越短越好。非單向流凈化車間自凈時間一般不超過30min。